ICCVS mieści się w centrum Gdańska i dysponuje nowoczesną przestrzenią laboratoryjną oraz specjalistyczną aparaturą badawczą najwyższej klasy (m.in. sorterem komórkowym BD FACSAria Fusion z komorą laminarną, 5 laserów; spektrometrem mas Orbitrap Exploris 480 firmy Thermo Fisher Scientific; konfokalnym mikroskopem laserowym FLUOVIEW FV3000 firmy Olympus oraz dwukomorowym systemem do hodowli komórkowych w warunkach hipoksji INVIVO2 1000 firmy Ruskinn Baker).
Naukowcy ICCVS mają również dostęp do infrastruktury laboratoryjnej Uniwersytetu Gdańskiego. Ścisła współpraca z dwiema największymi uczelniami publicznymi regionu – Gdańskim Uniwersytetem Medycznym (GUMed) oraz Politechniką Gdańską (PG) – umożliwia także korzystanie z ich zaplecza badawczego. Współpraca w ramach Związku Uczelni w Gdańsku im. Daniela Fahrenheita ułatwia wspólne wykorzystanie aparatury badawczej dzięki dedykowanej platformie internetowej.
Dzięki strategicznemu partnerstwu z Uniwersytetem w Edynburgu badacze ICCVS mają również dostęp do infrastruktury oraz platform badawczych w obszarach biologii komórek macierzystych, fenotypowego screeningu leków, biologii syntetycznej, bioinformatyki i medycyny weterynaryjnej.
Zapewnia to naszym naukowcom doskonałe warunki zarówno do prowadzenia własnych, niezależnych badań, jak i do udziału w międzynarodowych, interdyscyplinarnych programach badawczych i szkoleniowych dla doktorantów oraz pracowników naukowych.
Specjalistyczna aparatura badawcza ICCVS
Laboratorium Spektrometrii Mas
Spektrometr Mas Orbitrap Exploris 480
Orbitrap Exploris 480 to najbardziej zaawansowany przedstawiciel rodziny tandemowych spektrometrów Orbitrap. W porównaniu z modelem Orbitrap Exploris 480 HFX oferuje wyższą rozdzielczość (480 000 vs 240 000 przy 200 m/z) oraz większą czułość, co ogranicza liczbę wyników fałszywie dodatnich podczas identyfikacji peptydów i zwiększa wiarygodność uzyskiwanych danych. Aparatura może zostać rozbudowana o źródło OptaMax NG kompatybilne z systemem FAIMS Pro, umożliwiając jeszcze dokładniejszą identyfikację i analizę ilościową. Obsługuje również metodę Phased Spectrum Deconvolution, która zwiększa szybkość akwizycji danych w eksperymentach TMT. Konstrukcja urządzenia została zaprojektowana z myślą o maksymalnym uproszczeniu pracy operatora.
Barocycler NEP2320
Kompaktowe urządzenie laboratoryjne umożliwiające jednoczesne przetwarzanie do 16 próbek. Wykorzystuje opatentowaną technologię opartą na cyklicznych zmianach ciśnienia hydrostatycznego – od ciśnienia atmosferycznego do ultrawysokiego.
Zmiany ciśnienia przyspieszają trawienie proteolityczne, znacząco ograniczają liczbę błędów reakcji oraz zwiększają efektywność izolacji składników komórkowych, białek (w tym natywnych i nieredukowanych przeciwciał) oraz lipidów. Efekt ten wynika z większej aktywności enzymów pod wysokim ciśnieniem oraz lepszej dostępności miejsc wiązania w analizowanych cząsteczkach.
Technologia ta zapewnia szybkie i powtarzalne przygotowanie próbek do analiz biofarmaceutycznych, umożliwiając uzyskanie peptydów lub fragmentów białek gotowych do oczyszczania i analizy już po 2-4 godzinach od rozpoczęcia przygotowania.
Ultimate 3000 RSLCnano System – system niskoprzepływowej chromatografii cieczowej
Szeroki zakres przepływów, wysokociśnieniowa binarna pompa gradientowa, dodatkowa trójskładnikowa pompa mikroprzepływowa oraz zintegrowany moduł kolumn z dwoma zaworami przełączającymi sprawiają, że system UltiMate 3000 RSLCnano znajduje zastosowanie praktycznie we wszystkich analizach niskoprzepływowej chromatografii cieczowej i LC-MS, w tym w proteomice typu bottom-up i top-down oraz metabolomice.
Orbitrap LTQ XL
LTQ Orbitrap XL to kompleksowe rozwiązanie do identyfikacji, charakterystyki i analizy ilościowej białek. Urządzenie znajduje zastosowanie zarówno w rutynowej identyfikacji związków chemicznych, jak i w analizie bardzo niskich stężeń składników obecnych w złożonych mieszaninach. W ICCVS wykorzystywane jest przede wszystkim w badaniach lipidomicznych.
FTMS Booster – system akwizycji danych
FTMS Booster to wysokowydajny system akwizycji danych wykorzystujący unikalną technologię przetwarzania sygnału w czasie rzeczywistym. Umożliwia wizualizację sygnałów podczas pomiaru oraz zwiększa czułość, zakres dynamiczny i rozdzielczość pozyskiwanych danych. Jest szczególnie przydatny podczas analizy próbek o bardzo małej objętości, takich jak immunopeptydy i inne trudno dostępne związki. System jest kompatybilny ze wszystkimi platformami Orbitrap FTMS (LTQ Orbitrap, Exactive oraz Fusion Series).
Laboratorium Komórkowe
CGX10 Cell Isolation System
Sony CGX10 Cell Isolation System to nowoczesny, w pełni zamknięty system sortowania komórek przeznaczony do pracy w środowiskach zgodnych z wymaganiami GMP. Umożliwia izolację komórek o wysokiej czystości na podstawie wielu markerów jednocześnie, przy zachowaniu wysokiej żywotności komórek. Jest szczególnie przydatny w opracowywaniu terapii zaawansowanych, w tym terapii komórkowych i genowych. System wyposażono w intuicyjny ekran dotykowy, sterylne jednorazowe materiały eksploatacyjne oraz zaawansowaną technologię mikroprzepływową, zapewniającą szybkie i łagodne sortowanie przy minimalnym stresie komórek. Wysoki poziom automatyzacji i elastyczność zastosowań wspierają zarówno rozwój procesów, jak i produkcję kliniczną.
Invivo 1000 – komora hipoksyjna
Fizjologiczna stacja do hodowli komórkowych wyposażona w dwie niezależnie sterowane komory (każda o pojemności ok. 200 l). Umożliwia precyzyjną kontrolę stężenia tlenu i została zaprojektowana z myślą o eksperymentach wymagających wiernego odtworzenia fizjologicznych warunków tlenowych. Pozwala prowadzić badania nawet najbardziej złożonych interakcji komórkowych.
Cytometr Przepływowy BD FACSAria Fusion
W pełni cyfrowy sorter komórkowy umożliwiający jednoczesny pomiar 18 parametrów fluorescencji pojedynczej komórki. Wyposażony jest w stanowisko komputerowe z oprogramowaniem do sterowania urządzeniem i analizy wielokolorowej fluorescencji oraz zintegrowaną komorę laminarną klasy II A2. System wykorzystuje pięć chłodzonych powietrzem laserów i umożliwia jednoczesne sortowanie komórek do czterech populacji z wydajnością do 70 000 zdarzeń na sekundę.
HypoxyCOOL – system kondycjonowania pożywek
System umożliwia szybkie i precyzyjne obniżenie stężenia tlenu w pożywce hodowlanej do poziomu określonego przez użytkownika, przy jednoczesnym zachowaniu sterylności, odpowiedniego pH i temperatury. W standardowym protokole pracy (1% O₂, 5% CO₂, 120 obr./min) zawartość tlenu w pożywce zostaje obniżona do 2% w ciągu około dwóch godzin.
Aparatura do obrazowania
LYMPUS FLUOVIEW FV3000 – konfokalny mikroskop laserowy
Mikroskop konfokalny umożliwia prowadzenie badań z wykorzystaniem szerokiego zakresu technik obrazowania, w tym obrazowania makro- i mikroskopowego, mikroskopii superrozdzielczej oraz ilościowej analizy obrazu. Pozwala obserwować obiekty o różnej skali – od skrawków tkanek, przez komórki eukariotyczne i bakteryjne, po pojedyncze organella komórkowe i kwasy nukleinowe.
